TXT dosyasını FASTA'ya dönüştürme

1. Adım

Metin dosyasını, Not Defteri gibi bir metin düzenleme programında düzenlemek istediğiniz protein dizisi ile açın.

2. Adım

FASTA formatını takip etmek için açıklama satırını düzenleyin veya ekleyin. Örneğin, > gi | 129295 | sp | P01013 | OVAX_CHICK GENE X PROTEIN (OVALBUMIN-İLGİLİ) geçerli bir FASTA açıklama satırdır. Bu satır, aşağıdaki veri dizisi için benzersiz bir açıklama sağlar. FASTA formatı, sembolün (>) değerinden daha büyük bir şekilde kullanılmasını gerektirir, böylece program, benzersiz tanımlayıcı bilgiyi tanımlayabilir ve tanımlamayı bir protein sekansı verisi satırı olarak işlemden kaçınmak için.

3. adım

Açıklama satırını düzenledikten sonra satır sonu eklemek için "Enter" a basın.

4. Adım

Standart IUB / IUPAC kodlarına uymak için protein dizisi veri dizisinin biçimini düzenleyin veya ekleyin. IUB / IUPAC standardı, FASTA formatındaki amino asitler veya nükleik asitler için kabul edilebilir kodları veya sorgulama dizilerini temsil etmek üzere alfabenin harflerini kullanır. Örneğin, QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAE, glutamini temsil eden "Q" harfi ile başlayıp glutamatı temsil eden "E" harfi ile bittiğinden geçerli bir veri dizisi çizgisini temsil eder.

Adım 5

Daha fazla veri dizisi satırı ekleyin, mevcut olanları düzenleyin ya da 80 karakterden sonra satır sonları ekleyin. FASTA veri akışına hat standartları ve satır sonları eklemek, programın glutamin, glutamat ve diğer harf kodlarıyla ilgili talimatları takip etmesini sağlar. IUB / IUPAC standardındaki harfler, verileri FASTA formatında işleyen program için basit talimatlardır.

6. Adım

"Dosya" üzerine tıklayın, "Kaydet" düğmesini seçin ve tıklayın. TXT dosyanız zaten FASTA biçimindedir.